5月25日消息 - 美国一项研究显示，全基因组测序可为个体患者提供与临床相关的有用信息。研究发表于《柳叶刀》[Lancet 2010，375（9725）:1525]。　

    研究者对1例有血管疾病和早期猝死家族史的患者进行了评估。临床评估包括全基因组序列分析、冠状动脉疾病风险预测、心源性猝死原因筛查和遗传咨询。遗传学分析包括研发整合全基因组和临床风险的新方法。疾病和风险分析集中于与孟德尔遗传疾病、已知药物反应、新变异的致病性等相关的遗传变异风险。通过查阅疾病特异性突变数据库和药物基因组学数据库，确定与疾病和药物反应相关的已知基因和突变。通过将多种常见变异与测试前或然率相整合，得出似然比，以估计疾病测试后的或然率。　

    结果显示，经分析260万个单核苷酸多态性和752个拷贝数目变异后显示，该患者发生心梗、2型糖尿病和一些肿瘤的遗传风险增高；在3个基因内，与心源性猝死具有临床相关性的罕见变异为TMEM43、DSP和MYBPC3。LPA内的一个变异与冠状动脉疾病的家族史相符合。患者在CYP2C19内的一个杂合子无义突变提示可能对氯吡格雷耐药，与降脂治疗反应较好相关的几个变异，以及CYP4F2和VKORC1内的变异提示，在使用华法林时，该患者可能需要较低的起始剂量。

    述评：英国莱斯特大学的萨马尼（Samani）等　

    该研究中最令人信服的发现是与药物反应相关的内容，研究者确定了可影响患者对常用药物反应性的63个药物基因学变异。此外，研究者还确认了对药物反应有重要作用的6个新氨基酸变异。　

    该研究最有意思的地方在于，研究者将患者信息与诸如冠状动脉疾病和2型糖尿病等不断增多的常见疾病相关的大量变异相整合。由于大多上述常见病的已知变异对个体的指导作用较小，因此在临床上将这些发现转化成可以预测个体的情况非常具有挑战性（下表）。